这个问题不大。如果是我自己手写Apache conf文件，我一般不会用到NameVirtualHost。
我发现这个问题出现在Godaddy Server上，预装的是Godaddy自带的Simple Control Panel。Simple Control Panel会把Virtual Host信息保存在simplepanel.conf。如果通过Simple Control Panel重启Apache，不会看到任何症状；但如果在ssh下运行/etc/init.d/httpd restart，就会有若干个Warning “NameVirtualHost xxx.xxx.xxx.xxx:80 has no VirtualHosts”。
Simple Control Panel为每个配置的域名都添加一个ip-based NameVirtualHost directive，其实是不必要的，过多相同的NameVirtualHost就导致了Warning，删掉就可以了。